Kirkkomusiikin suuntautumisvaihtoehdossa perehdytään ortodoksisen kirkon teologiaan niin akateemisen tutkimuksen kuin kirkollisen käytännönkin näkökulmasta. Lisäksi opintoihin sisältyy monipuolinen säveltaiteellinen koulutus: kuoronjohtoa, yksinlaulua, pianonsoittoa ja musiikinteoreettisia aineita. Maisterin tutkintoon sisältyvän pro gradu -tutkielman voi kirkkomusiikissa suorittaa myös tieteellistaiteellisena produktiona.
Kirkkomusiikin suuntautumisvaihtoehdossa suoritettu maisterin tutkinto antaa kelpoisuuden ortodoksisen kirkon työsuhteisen kanttorin tehtäviin. Lisäksi koulutus avaa erilaisia urapolkuja ortodoksisen teologian ja musiikin erityisosaamista vaativissa tehtävissä.
Opintoihin kuuluvissa soveltavissa opinnoissa suoritetaan liturgiset harjoitukset Ortodoksisen seminaarin jumalanpalveluksissa. Lisäksi suoritetaan kirkolliset soveltavat opinnot seurakuntaharjoitteluna tutustuen kanttorin tehtäviin.
